Studentkinja Silvija Subotić je u petak, 12. jula 2024. godine odbranila svoj master rad na temu Detekcija genomskih strukturnih varijacija upotrebom pangenomskih grafova pred mentorom dr Goranom Rakočevićem i članovima komisije dr Nemanjom Ilićem i dr Brankom Zukić.
U uvodu svog rada Silvija je istakla:
Razvoj tehnologija za sekvenciranje genoma doneo je revoluciju u oblasti genomike, što je omogućilo detaljan uvid u genetsku raznolikost i kompleksnost. Identifikacija strukturnih varijacija u genomu, kao što su velike insercije, delecije, duplikacije, inverzije i translokacije, od ključnog je značaja za razumevanje genetske osnove razvoja mnogih bolesti i bioloških procesa. Međutim, tradicionalni linearni pristupi analizi genoma često ne uspevaju da adekvatno prikažu složenost i varijabilnost genomskih sekvenci između različitih populacija.
…
Na osnovu svega prezentovanog u radu možemo zaključiti da upotreba pangenomskih grafova povećava broj detektovnih strukturnih varijacija u odnosu na tradicionalno korišćene linearne modele. Nesumnjivo najviše varijacija detektovano je pangenomskim pristupom, i to grafom koji je obogaćen strukturnim varijacijama iz Polaris studije. – zaključila je Silvija.
Fotografije sa odbrane dostupne su u galeriji.