Studentkinja Računarskog fakulteta Ksenija Ćesarević je u četvrtak, 4. septembra 2025. godine odbranila diplomski rad na temu Sistem za obradu, skladištenje i pretraživanje podataka sekvencirane jednoćelijske RNK pred komisijom koju su činili mentor dr Goran Rakočević i članovi dr Bojana Dimić Surla i dr Nemanja Radosavljević.
U apstraktu svog rada Ksenija je istakakla:
Ovaj master rad predstavlja razvoj i implementaciju integrisane platforme za upravljanje podacima sekvenciranja jednoćelijske RNK . Ova platforma kombinuje automatizovanu obradu podataka kroz Nextflow radne tokove sa naprednim sistemima za pretraživanje i analizu rezultata. Predloženi sistem omogućava standardizovanu obradu eksperimentalnih podataka kroz reproducibilne Nextflow protokole, centralizovano skladištenje metapodataka i eksperimentalnih parametara u optimizovanoj relacionoj bazi podataka, kao i inteligentno pretraživanje podataka kombinovanjem tradicionalnih tehnika indeksiranja sa naprednim pristupima veštačke inteligencije.
…
Modularna arhitektura sistema postavlja osnovu za buduću integraciju algoritma mašinskog učenja i veštačke inteligencije u analizu jednoćelijskih podataka. Fleksibilnost platforme omogućava inkrementalno dodavanje novih analitičkih komponenti, što je čini adaptivnom za tehnološke inovacije u oblasti scRNA-seq metodologija. Implementacija cloud-native tehnologija i horizontalnog skaliranja pozicionira sistem kao potencijalno rešenje za velika populacijska istraživanja kancera. Ovakav pristup može značajno ubrzati translaciju naučnih otkrića u kliničku praksu kroz omogućavanje analize velikog broja pacijenata.
Rad predstavlja uspešnu sintezu biološkog razumevanja malignoma, savremenih eksperimentalnih metoda jednoćelijskog sekvenciranja i naprednog softverskog inženjerstva. Rezultujući sistem ne samo da automatizuje analizu kompleksnih genomskih podataka, već aktivno katalitizuje istraživanja u oblasti precizne onkologije kroz omogućavanje novih naučnih pristupa i metodologija. – zaključila je Ksenija.