Студенткиња Рачунарског факултета Јелена Ђоковић је у четвртак, 18. децембра 2025. године одбранила дипломски рад на тему Примена De Bruijn графова у хибридним de novo асемблерима у биоинформатици пред комисијом коју су чинили ментор др Горан Ракочевић и члан др Марко Младеновић.
У апстракту свог рада Јелена је истакла:
Овај рад описује примену De Bruijn графова у хибридном de novo асембловању генома. De Bruijn графови су се показали као моћан алат у организовању и представљању секвенцираних података. Методе хибридног асембловања паралелно користе технике секвенцирања кратких и дугих очитавања и на тај начин добијају прецизније и дужe секвенце непознатог генома. De Bruijn графови се налазе у језгру модерних асемблера на бази кратких очитавања, док њихова улога у хибридним асемблерима још увек није до краја дефинисана. Примена De Bruijn графова у хибридним асемблерима отвара могућност за потпунију искоришћеност савремених техника секвенцирања и решавање још увек отворених проблема као што су: репетитивни региони, структурне варијације, утицај грешака које се појављују у секвенцираном геному, резултујући високо прецизним реконструкцијама генома.
…
Иако De Bruijn графови нису примарна метода за асембловање генома уз помоћ дугих очитавања, њихово укључивање у хибридне assemblere показује обећавајуће перспективе за превазилажење ограничења повезаних са појединачним технологијама секвенцирања. Интегришући податке са платформи кратких и дугих очитавања, хибридни assemblere користе предности сваке технологије, што доводи до побољшане тачности асембловања, континуитета и комплетности крајњег резултата. Флексибилност De Bruijn графова као графовског приказа секвенцираних података омогућава ефикасну организацију и анализу геномске информације, олакшавајући асембловање великих и сложених генома. Наставак истраживања и развоја хибридних метода асембловања, искоришћавањем предности De Bruijn графова, има потенцијал да унапреди наше разумевање структуре и функције генома, што коначно доводи до иновација са дубоким импликацијама за различите области. – закључила је Јелена.